Etter to filmer om islam, homofili og feminisme, ønsker Nefise, en kvinnelig muslimsk filmskaper, å utforske forholdet mellom patriarki og makt i islam. Hun vil utforske den maskuline kulturen, hvorfor den er som den er og hvordan den stadig reproduseres. I hennes intimportrett av muslimske menn som ønsker å utfordre patriarkiet og endre det, får vi et helt nytt innblikk i hva som rører seg i den muslimske verden. Det kan se ut som en Davids kamp mot Goliat – men hvem vinner? I filmen møter vi blant annet psykologen og skaperen av The 99, Naif Al-Mutawa fra Kuwait, lederen for anti-kapitalistiske muslimer i Tyrkia, Ihsan Eliacik og aktivistene Imtiaz Pavel fra Bangladesh og Syaldi Suhade fra Indonesia, som begge jobber med problemstillinger rundt rettferdighet og likestilling mellom kvinner og menn. Disse er noen av mange menn som systematisk jobber for å skape en ikke-patriarkalsk islam, som vesten sjeldent hører noe om. Mannislam gir et unikt innblikk i deres historier.