Etter å ha mistet kona for syv år siden, holder den eksentriske Dr. John Dolittle - den berømte legen og veterinæren i dronning Victorias England - bak de høye murene i Dolittle Manor, med bare de eksotiske dyrene sine som selskap. Men når den unge dronningen blir alvorlig syk, blir Dolittle motvillig nødt til å begi seg ut på et episk eventyr til en mystisk øy på jakt etter et botemiddel.