Ghost Dog bor over verden, ved siden av en flokk med fulger, i et hjemmelaget skur på taket av en forlatt bygning. Ghost Dog er en profesjonell leiemorder, med evne til å løse seg opp i nattens mulm og mørke og til å bevege seg usett gjennom byen. Han er ledet av ordene i en gammel samuraitekst. Når han blir forrådt av den dysfunksjonelle mafiafamilien han av og til jobber for, reagerer han nøyaktig etter oppskrift fra The Way of the Samurai, det som står i den gamle samuraiteksten. "Vi er som to gamle stammer, begge nesten utdødd og alt ser ut til å endres rundt oss".